Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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