Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ECM1Q16610 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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