Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SSPNQ14714 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SSPNQ14714 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms