Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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DDX39BQ13838 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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DDX39BQ13838 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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DDX39BQ13838 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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DDX39BQ13838 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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DDX39BQ13838 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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DDX39BQ13838 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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DDX39BQ13838 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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