Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CACNA1SQ13698 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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