Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HTR4Q13639 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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