Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms