Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCIRG1Q13488 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms