Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms