Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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