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| FOXF2 | Q12947 | PDCL2P2-201 | ENST00000533651 | 189 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC093012.1-203 | ENST00000548437 | 450 nt | TSL 2 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AC025470.1-201 | ENST00000510053 | 2032 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | TCF7L2-217 | ENST00000536810 | 3953 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | LINS1-207 | ENST00000560133 | 1196 nt | TSL 2 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AC015720.2-201 | ENST00000567709 | 334 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AL161896.1-201 | ENST00000597248 | 508 nt | TSL 4 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AC241377.1-201 | ENST00000619797 | 406 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | TADA2A-212 | ENST00000620367 | 1043 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC024595.1-201 | ENST00000623088 | 387 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC007494.3-201 | ENST00000624660 | 743 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MVP-219 | ENST00000629059 | 120 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CREM-206 | ENST00000354759 | 1589 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CRYZ-204 | ENST00000370872 | 1592 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC012020.1-201 | ENST00000624541 | 1728 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | BX322639.1-201 | ENST00000609841 | 6590 nt | TSL 4 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | UGT2A2-202 | ENST00000604629 | 1676 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CSNK1G1-204 | ENST00000606793 | 1658 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | NAT1-203 | ENST00000517492 | 2280 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | TESPA1-203 | ENST00000524622 | 4188 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | NRG3-202 | ENST00000372142 | 3136 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SLC4A4-202 | ENST00000340595 | 7640 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SCN1A-203 | ENST00000409050 | 5946 nt | TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |