Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXF2Q12947 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms