Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
EFEMP1Q12805 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms