Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCAPQ12770 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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