Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CENPFP49454 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CENPFP49454 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CENPFP49454 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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CENPFP49454 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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CENPFP49454 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CENPFP49454 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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