Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXD10P28358 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXD10P28358 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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HOXD10P28358 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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