Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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