Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.2 ms