Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RNF17Q9BXT8 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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