Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TMIEQ8NEW7 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms