Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PPFIA2-216ENST00000549396 5363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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