Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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