Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDK4Q16654 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms