Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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SYCP1Q15431 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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SYCP1Q15431 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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SYCP1Q15431 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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SYCP1Q15431 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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