Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGB3BPQ13352 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms