Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1BQ13112 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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