Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAF1Q13077 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms