Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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