Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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FOXF2Q12947 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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FOXF2Q12947 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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FOXF2Q12947 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXF2Q12947 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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