Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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PTPRAP18433 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRAP18433 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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