Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LRRTM2O43300 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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