Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CIPCQ9C0C6 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms