Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
UBXN4Q92575 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
UBXN4Q92575 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms