Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
COL24A1Q17RW2 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms