Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms