Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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SYCP1Q15431 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SYCP1Q15431 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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