Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BRD3Q15059 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms