Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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CHD4Q14839 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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CHD4Q14839 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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