Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SMCO1Q147U7 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms