Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RFTN1Q14699 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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RFTN1Q14699 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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RFTN1Q14699 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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RFTN1Q14699 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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RFTN1Q14699 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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RFTN1Q14699 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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