Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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PTCH1Q13635 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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PTCH1Q13635 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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PTCH1Q13635 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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PTCH1Q13635 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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PTCH1Q13635 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTCH1Q13635 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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