Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CUL1Q13616 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL1Q13616 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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