Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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