Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPN13Q12923 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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