Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BPTFQ12830 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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