Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KCNH2Q12809 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KCNH2Q12809 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms