Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
VPREB1P12018 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms