Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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LRRTM2O43300 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
LRRTM2O43300 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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