Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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USP35Q9P2H5 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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USP35Q9P2H5 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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USP35Q9P2H5 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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USP35Q9P2H5 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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USP35Q9P2H5 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP35Q9P2H5 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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USP35Q9P2H5 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
USP35Q9P2H5 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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