Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
EHD3Q9NZN3 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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