Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PKP4Q99569 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms